Koku, filtreleme çözümleri arasında en ciddi ve hassas davranılması gereken unsurdur. En ufak bir hata, kullanılacak ekipmanın tamamen işlevini yitirmesine sebep olabileceği gibi, yapılan yatırımların boşa gitmesine de neden olabilir. Koku filtreleme için en sık kullanılan yöntem aktif karbon filtrelemedir. Ancak aktif karbonun tek başına yeterli olmadığı projelerde, ozon jeneratörü ile desteklenerek, ortamdaki koku minimum seviyeye indirilir.